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Balancing Workload Performance and Slurm Stress: Four Nextflow Deployment Strategies

平衡工作负载性能与Slurm压力：四种Nextflow部署策略

Nil Tianchen Mu, William Dizon, Glen Otero, Torey Battelle

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本文提出可复现测量协议，在ASU Phoenix和Dev集群评估四种Nextflow部署策略，发现存在时间与RPC的权衡，助力HPC站点选择兼顾性能与调度器压力的部署方案。

Belyi map verification using certified path tracking

利用认证路径跟踪验证Belyi映射

Alexandre Guillemot, John Voight

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 通过认证同伦持续方法计算数域上Belyi映射的monodromy，应用于LMFDB中Belyi映射的monodromy三元组认证。

SoK: From Silicon to Netlist and Beyond $-$ Two Decades of Hardware Reverse Engineering Research

SoK：从硅到网表及更远——硬件逆向工程研究二十年

Zehra Karadağ, Simon Klix, René Walendy, Felix Hahn, Kolja Dorschel, Julian Speith, Christof Paar, Steffen Becker

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本文系统化梳理了硬件逆向工程二十年的研究进展，分析了技术方法及挑战，提出提升可复现性、标准化评估和法律清晰度的建议。

Comments Accepted at IACR Transactions on Cryptographic Hardware and Embedded Systems (TCHES), Vol. 2026, No. 4

On the $k$ Nearest-Neighbor Path Distance from the Typical Intersection in the Manhattan Poisson Line Cox Process

Konstantinos Koufos, Harpreet S. Dhillon, Mehrdad Dianati, Carl P. Dettmann

专题命中 工作流自动化 ：planning(abstract)

Journal ref IEEE Trans. Mobile Computing 22 1659-1671 (2021)

A multi-level preprocessing and modelling framework for spectral imaging of microplastics

微塑料光谱成像的多级预处理与建模框架

Zina-Sabrina Duma, Tenzin Tsering, Sara Heikkinen, Tuomo Soininen, Tuomas Sihvonen, Arto Koistinen, Satu-Pia Reinikainen

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本研究提出一种微塑料FT-IR光谱成像的多级预处理与建模框架，通过多尺度校正及聚类中心光谱匹配，提升了微塑料识别的鲁棒性、效率与可解释性，对四种塑料实现完美分类且处理时间大幅缩短。

TEAMS: Text-prompted spatiotEmporal dual-heAd Mamba Snake

TEAMS：文本提示的时空双路头Mamba Snake

Ruicheng Zhang, Jianhui Lei, Kaiwen Shen, Haowei Guo, Jun Zhou, Bin Chen, Mengtang Li, Shen Zhao, Shuo Li

机构 * School of intelligent systems engineering, Sun Yat-sen University（中山大学智能系统工程学院） ； Affiliated Hangzhou First People’s Hospital, Zhejiang University School of Medicine（浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院） ； School of Engineering, Case Western Reserve University（凯斯西储大学工程学院） 纠错

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 该研究提出视觉-语言Mamba框架TEAMS，通过三项创新改进深度蛇方法，在五个医学图像数据集上较现有方法取得显著性能提升，可作为多种医学图像分割场景的可靠工具。

Comments Medical Image Analysis (MedIA), 2026, In Press, Online Early Access Available

Automatic Transcription of Microtonal Free-Rhythm Vocal Music: A Case Study in Iranian Classical Music

微分音自由节奏声乐的自动转录：以伊朗古典音乐为例

Sepideh Shafiei, Shapour Hakam, Harsh Dange, Joel Rodriguez Caraballo

机构 * Cu Test Inc.（Cu Test公司） 纠错

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本文以伊朗古典音乐为案例，提出结合音高直方图与DTW的自动转录工作流程，采用music21库实现，可转录含tahrir等装饰音的微分音声乐，配套可视化与编辑工具，推进计算民族音乐学发展。

Parallel single-pixel imaging based on modulation region expansion and overlapping reconstruction

基于调制区域扩展与重叠重建的并行单像素成像

Yinran Shen, Xuri Yao, Shijian Li, Chao Shen, Yuhao Wang, Chongwu Shao, Qing Zhao

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 该研究针对并行单像素成像校准繁琐且对噪声敏感的问题，提出基于调制区域扩展与重叠重建的策略，实现更优成像质量与鲁棒性，简化了工作流程，适用于高分辨率高速计算成像。

Atomistic Structure Generation and Neural-Network Screening of Hard Carbons to Identify High-Capacity Sodium Storage

硬碳的原子级结构生成与神经网络筛选以识别高容量钠存储材料

Harry Mclean, Aiden Daniel Emery, Theodore Thomas Walton, Ned Thaddeus Taylor, Steven Paul Hepplestone

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本研究结合通用机器学习原子间势与RAFFLE框架生成13096个硬碳模型，训练神经网络代理筛选出容量超800 mAh g⁻¹的高容量钠存储候选材料，建立了硬碳微观结构与钠存储性能的关联。

NMMA-Astro-COLIBRI: An Automated Light-Curve Supernovae Classification Service in the Multi-Survey Era

NMMA-Astro-COLIBRI：多巡天时代的自动光变曲线超新星分类服务

R. Weizmann Kiendrebeogo, Bernardo Cornejo Avila, Sofia Bisero, Maxime Cellier, Antoine Ciric, Ilja Jaroschewski, Henrik Rose, Alexandre Saint-Paul, Fabian Schüssler

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本研究推出NMMA-Astro-COLIBRI自动分类服务，通过贝叶斯方法结合NMMA与Astro-COLIBRI平台，以超新星模板库实现暂现源分类，在SN 2021ugl案例中验证了其对千新星的区分能力。

Bootstrap Current Modeling in M3D-C1

Saurabh Saxena, Nathaniel Ferraro, Mike F. Martin, Adelle M. Wright

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

Comments 15 pages, 8 Figures

Misspecification-Robust Shrinkage and Selection for VAR Forecasts and IRFs

针对VAR预测与脉冲响应函数（IRFs）的 misspecification 鲁棒收缩与选择方法

Oriol González-Casasús, Frank Schorfheide

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 该研究针对 VAR 预测与 IRF 估计的 misspecification 问题，提出 PC 和 IRFC 准则，实现了候选估计量、贝叶斯收缩程度与滞后阶数的联合选择，为相关研究提供了 misspecification 鲁棒的工作流程。

Design-Based Inference under Deep Domain Stratification: Language of Instruction and Private-Institution Choice in India's NSS 71st Round

深度域分层下基于设计的推断：印度第71轮全国抽样调查中的教学语言与私立机构选择

Aksaj Goel, Abhishek Bhattacharjee

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本文针对大型家庭调查多次细分后统计脆弱的问题，开发了可审计的基于设计的推断框架，结合印度第71轮全国抽样调查数据验证了该方法的有效性。

Comments 102 pages , 24 Tables and 4 Histograms

PersonaEval: Persona-Based User Simulation for Evaluating Interactive Applications

PersonaEval：用于评估交互式应用的基于角色的用户模拟

Yifan Simon Liu, Qianfeng Wen, Yilan Fan, Shirley Huang, Ruoqi Gao, Jianheng Hou, Muhammad Ahmed Mohsin, Zonglin Di, Brihi Joshi, Xincheng Tan, Yucheng Lu, Xiaoyi Liu, Heming Liu, Hanwen Xing, Guanghui Min, Zhengyang Shan, My Chiffon Nguyen, Ishan Gupta, Yunze Xiao, Hannah Collison, Jintao Huang, Jiatong Li, Sankalp Jajee, Yunhan Zhao, Bing Hu, Sky Ng, Xupeng Chen, Binghang Lu, Weihang Xiao, Aravind Mohan, Bolun Sun, Yunshu Wu, Yuanda Xu, Yun Shen, Runyu Zhang, Zheyuan Deng, Zhiwei Zhang, Qianyu Zhu, Dianzhuo Wang, Yijun Wang, Yixuan He, Yuexing Hao, Xiaomin Li

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 针对真实用户研究成本高、难扩展的问题，提出PersonaEval框架，可在三类交互式应用上实现可重复、可并行的用户模拟评估。

Robust structure from motion for aerial-ground images via detector-free feature matching and multi-view track refinement

基于无检测器特征匹配与多视图轨迹优化的空地图像鲁棒运动恢复结构

San Jiang, Hui Wang, Xing Zhang, Zhongwen Hu, Zhijun Wang, Ruisheng Wang, Wanshou Jiang, Qingquan Li

机构 * School of Architecture and Urban Planning, Shenzhen University（深圳大学建筑与城市规划学院） ； Guangdong Key Laboratory of Urban Informatics, Shenzhen University（深圳大学广东省城市信息学重点实验室） ； MNR Key Laboratory for Geo-Environmental Monitoring of Great Bay Area, Shenzhen University（深圳大学自然资源部大湾区地理环境监测重点实验室） 纠错

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本研究提出结合无检测器匹配网络与多视图轨迹优化的方法，用于解决空地图像三维重建中特征匹配鲁棒性问题，在5°位姿误差下AUC较LoFTR提升93.9%，实现更高精度的ISfM重建。

From the SIR/SEIR/SVEIR Model to a Chemotactic System: Analysis of Spatiotemporal Mechanisms of Infection Spread within the Einstein Paradigm

从SIR/SEIR/SVEIR模型到趋化系统：爱因斯坦范式内感染传播的时空机制分析

Yizhou Wang, Evgenia Echkina

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 该研究以SIR/SEIR/SVEIR等传染病模型为基础，构建含恐惧/规避效应的扩散-趋化PDE系统，结合数值方法分析感染传播的时空机制，其参数经真实流感数据校准验证。

Comments 31 pages, 12 figures

Exploring Initial CO2 Transport Topologies for Germany's Carbon Management

探索德国碳管理的初始CO₂输运拓扑结构

Toni Seibold, Luna Lütz, Tom Brown

专题命中 工作流自动化 ：planning(abstract)

AI总结 本研究结合图论拓扑生成与多部门耦合能源系统模型，评估德国2035年CO₂输运网络，发现接入关键工业源区与汇点时，输运基础设施可用性比拓扑结构更重要，500公里管道可获大部分经济收益

Scientific applications of quantum computing: challenges and opportunities

量子计算的科学应用：挑战与机遇

Bruno Camino, C. Richard A. Catlow, John Buckeridge, Alin M. Elena, Vladimir V. Gusev, Sarah Harris, Thomas W. Keal, Glenn Jones, Vivien Kendon, Syma Khalid, Phalgun Lolur, Jamal A. Nasir, Matthew J. Rosseinsky, Chris-Kriton Skylaris, Paul A. Warburton, Scott M. Woodley

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本文探讨量子计算在化学、材料科学等领域的科学应用，指出其核心挑战是获得化学意义的预测可靠性增益，近期价值来自工作流程整合，需结合特定场景判断实用性。

Assessing the Projector Augmented-Wave Method for Stopping Power Calculations

评估用于阻止功率计算的投影缀加波方法

Bryn Lloyd, Dirk O. Gericke, Gilles Rodway-Gant, Gianluca Gregori

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本研究评估投影缀加波（PAW）方法用于阻止功率模拟的适用性，开发了适配的PAW数据集生成选择工作流，应用于面心立方铝的质子阻止研究，探究了数据集设计及晶体沟道效应对带电粒子输运的影响。

Comments 11 pages, 5 figures

Synthesizing like a chemist: an iterative, feedback-driven loop for materials discovery

像化学家一样合成：用于材料发现的迭代式反馈驱动循环

Fang Sheng, Steven B. Torrisi, Amanda Volk, Kevin Tran, Koki Nakano, Brian W. Anthony, Tonio Buonassisi

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 该研究提出一种结合LLM、高光谱成像与多目标贝叶斯优化的闭环框架，可自动化材料合成工作流程，在配对优化中表现优于基线方法，还成功合成了未报道的钙钛矿型化合物Rb3BiI6薄膜。

Comments 38 pages, 5 figures

Morphology-Guided Deterministic Fabrication of Low-Noise High-Temperature Superconducting Quantum Interference Devices

形貌引导的低噪声高温超导量子干涉器件的确定性制备

Bingke Xiang, Wanjuan Tang, Shiqun Liu, Lingtong Hou, Geming Zhang, Yibo Wang, Ruonan Wang, Zhiqiang Cao, Jiaqi Wei, Xueshen Wang, Xueying Zhang, Xiaoyang Lin

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 该研究开发了一种位点选择性制备流程，利用原子力显微镜引导制备，实现了液氮温度下40 fT·Hz^(-1/2)的低噪声HTS SQUIDs，解决了晶界局部变异性问题，为规模化制造高均匀性器件提供了途径。

Comments 12 pages, 4 figures

Parallelizable Exact Synthesis of Quantum Circuits via Semi-Tensor Product

基于半张量积的量子电路并行精确合成

Chenjian Li, Dingchao Gao, Xiangzhen Zhou, Ji Guan, Pengcheng Zhu, Zhufei Chu

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 针对现有量子电路精确合成方法的不足，本文基于半张量积理论，为CNOT和相位多项式电路引入并行精确合成框架，通过特定枚举和求解方式实现并行加速，在小实例上比基线快，在实际工作流程中多数情况表现更优。

Phonon-Mediated Thermal Transport in Nanocrystalline Silicon Using Machine-Learning Interatomic Potentials

使用机器学习原子间势研究纳米晶硅中的声子介导热输运

Houssem Rezgui, Catalina Coll Benejam, Clivia M. Sotomayor Torres, Miguel Pruneda

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 研究结构复杂材料中声子介导热输运难题，结合高斯近似势、多原子团簇展开模型等，开发机器学习框架模拟纳米晶硅热输运，计算相关参数，揭示晶界热边界电阻特性，相比传统势，该框架描述更准确自洽，利于低维材料热输运建模。

Carruthers Data Processing Pipeline: Radiometric Responsivity Calibration

Carruthers GCI 在轨标定：辐射灵敏度

Alex Zhang, Heather Filippini, Gonzalo Cucho-Padin, Lara Waldrop, John Clarke, Pratik Joshi, Parisa Karimi, Martin M. Sirk

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 针对Carruthers GCI仪器辐射标定需求，提出基于CALSPEC标准星库的算法驱动星选方法，通过反演观测流量约束通带，仿真验证反演误差<7%。

Comments Preprint, under review at Space Science Reviews

Variational Quantum Eigensolver-Based Quantum Bootstrap Embedding for Molecules

基于变分量子本征求解器的量子自举嵌入方法用于分子

Derek Peng

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 提出量子自举嵌入（QBE）工作流，使用变分量子本征求解器（VQE）作为碎片求解器，通过引入FastAdaptVQE和MatrixFreeAdaptVQE算法及前瞻性算子选择策略，在H4和F2分子上达到化学精度，为近量子硬件上更大分子系统的能量计算奠定基础。

Comments 24 pages, 4 figures, 4 tables. Code available at: https://github.com/littlebullGit/QBEMol

Kubo-Martin-Schwinger-Gated Imaginary-Time Reconstruction of Time-Resolved Electronic Circular Dichroism in Organic Excitonic Aggregates

Kubo-Martin-Schwinger-Gated Imaginary-Time Reconstruction of Time-Resolved Electronic Circular Dichroism in Organic Excitonic Aggregates

Christian Tantardini, Caterina Cocchi

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 本文提出了一种基于Kubo-Martin-Schwinger门控准则的虚时间重建方法，用于时间分辨电子圆二色谱（TR-ECD）和时间分辨圆二色谱（TRCD）在有机激发子聚集体中的研究，通过结合状态层面与可观测层面的距离分析，确定何时可以使用虚时间参考进行重建，何时需要实时或Keldysh动力学。

A Machine-Learning Framework for Efficient Ring-Polymer Instanton Rate Calculations

利用机器学习代理实现高效瞬子速率计算

Chenghao Zhang, Amke Nimmrich, Axel Gomez, Munira Khalil, Niranjan Govind

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 提出高斯过程回归增强线积分弦方法，加速分子质子转移反应中隧穿速率的环聚合物瞬子计算，通过代理模型的不确定性估计使力评估次数与离散化珠子数无关，并采用高效训练策略实现数量级加速。

Comments 42 pages, 4 figures, 3 tables

Evaluating the impact of incomplete contact tracing data on urban epidemic dynamics

缺失的链接：在大都市地区疫情期间使用不完整数据进行接触者追踪的评估

Min-Kyung Chae, Woo-Sik Son, Sang Hoon Lee

专题命中 工作流自动化 ：agent(abstract)

AI总结 通过基于主体的随机模型模拟韩国大都市区信息缺失对接触者追踪效果的影响，发现感染者遗漏率超过城市特定阈值（首尔约4%，釜山约10%）时追踪失效，且感染者遗漏比接触遗漏导致更剧烈的传播结构变化。

Comments 14 pages, 8 figures, 1 table

Accurate and efficient protocols for high-throughput first-principles materials simulations

Gabriel de Miranda Nascimento, Flaviano José dos Santos, Marnik Bercx, Davide Grassano, Giovanni Pizzi, Nicola Marzari

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

Journal ref G. de Miranda Nascimento et al., npj Computational Materials 12, 272 (2026)

A compensatory model for quantile estimation and application to VaR

用于分位数估计的补偿模型及其在风险价值（VaR）中的应用

Xiaoyuan Tian, Shuzhen Yang

专题命中 工作流自动化 ：workflow(abstract)

AI总结 该研究提出补偿模型作为覆盖校正层，嵌入新惩罚项得到自适应分位数估计器，经标普500和纳斯达克数据回溯测试，其在四种VaR估计器上的无条件覆盖误差显著低于基准模型。

Comments 10 pages, 1 figures