基于核的最小分布电荷：用于分子模拟的构象依赖ESP模型
Kernel-based Minimal Distributed Charges: A Conformationally Dependent ESP-Model for Molecular Simulations
AI总结：
提出核化最小分布电荷模型（kMDCM），利用随分子几何自适应的非中心点电荷表示静电势，结合再现核实现2000个水分子纳秒级能量守恒模拟，精度较传统模型提升至少2倍。
摘要：
一种基于核的方法（核化最小分布电荷模型 - kMDCM），用位置随分子几何结构自适应的非中心点电荷来表示分子静电势（ESP）。使用高斯核和原子-原子距离作为特征，水与甲醇的ESP相比拟合结构系综的点电荷模型至少改善了2倍。结合kMDCM处理静电项与再现核处理成键项，实现了在纳秒时间尺度上对具有周期边界条件的2000个水分子进行能量守恒模拟。
英文摘要：
A kernel-based method (kernelized minimal distributed charge model - kMDCM) to represent the molecular electrostatic potential (ESP) in terms of off-center point charges whose positions adapts to the molecular geometry. Using Gaussian kernels and atom-atom distances as the features, the ESP for water and methanol is shown to improve by at least a factor of two compared with point charge models fit to an ensemble of structures. Combining kMDCM for the electrostatics and reproducing kernels for the bonded terms allows energy-conserving simulation of 2000 water molecules with periodic boundary conditions on the nanosecond time scale.
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