PETIMOT: A Novel Framework for Inferring Protein Motions from Sparse Data Using SE(3)-Equivariant Graph Neural Networks
PETIMOT:一种利用SE(3)-等变图神经网络从稀疏数据推断蛋白质运动的新框架
机构 * Department of Computational, Quantitative, and Synthetic Biology (CQSB), UMR 7238 IBPS, Sorbonne Université, CNRS(索邦大学国家科学研究中心计算、定量与合成生物学系(CQSB),UMR 7238 IBPS) ; Univ. Grenoble Alpes, CNRS, Grenoble INP, LJK(格勒诺布尔阿尔卑斯大学国家科学研究中心格勒诺布尔国立理工学院让·库尔实验室(LJK)) ; Institut universitaire de France (IUF)(法国大学研究院(IUF))
AI总结 提出PETIMOT框架,利用SE(3)-等变图神经网络和预训练蛋白质语言模型,从稀疏实验数据推断蛋白质连续紧凑运动表示,在捕捉大/慢构象变化方面优于扩散、流匹配及传统物理模型。
Journal ref LMRL Workshop at ICLR 2025; Acta Crystallographica Section D 2026