医学 AI

When Retrieval Helps and Distracts: Evaluating Evidence-Generating LLMs for Biomedical Claim Verification

检索何时有助何时干扰：评估用于生物医学声明验证的生成证据的大型语言模型

Pritam Deka, Prabhjot Singh

机构 * Queen’s University Belfast（贝尔法斯特女王大学） ； University of Texas at Austin（德克萨斯大学奥斯汀分校） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title,abstract)

AI总结 该研究针对生物医学声明验证，在CARE-XAI基准上对比多种模型，发现微调大型语言模型生成证据能力最强，PubMed检索效果因来源而异，还提出Bio-GRACE工具评估检索效用，推动选择性检索发展。

Towards World Models in Biomedical Research

迈向生物医学研究的世界模型

Guangyu Wang, Jingkun Yue, Siqi Zhang, Yu Liu, Xiaoyu Wang, Mingyuan Meng, Changwei Ji, Zongbo Han, Yulin Wang, Yang Yue, Frank Fu, Ting Chen, Song Wu, Ziwei Liu, Jiangning Song, Ming Li, Gao Huang, Xiaohong Liu, Athanasios Vasilakos, Xingcai Zhang, Ping Zhang, Yong Li

机构 * State Key Laboratory of Networking and Switching Technology, Beijing University of Posts and Telecommunications, Beijing, China（网络与交换技术国家重点实验室，北京邮电大学，北京，中国） ； Department of Engineering Science, University of Oxford, Oxford, United Kingdom（英国牛津大学工程科学系，牛津，英国） ； Institute of Medical Artificial Intelligence, South China Hospital, Medical School, Shenzhen University, Shenzhen, Guangdong, China（医学人工智能研究所，南方医院，医学学院，深圳大学，深圳，广东，中国） ； Zhongguancun Academy & Zhongguancun Institute of Artificial Intelligence, Beijing, China（中关村学院及中关村人工智能研究院，北京，中国） ； Beijing National Research Center for Information Science and Technology (BNRist), Tsinghua University, 100084, Beijing, China（北京信息科学与技术国家研究中心（BNRist），清华大学，100084，北京，中国） ； Department of Chemical and Nano Engineering, University of California, San Diego, La Jolla, CA, USA（美国加州大学圣地亚哥分校化学与纳米工程系，La Jolla，CA，美国） ； Nanyang Technological University, Singapore（新加坡南洋理工大学） ； Monash Biomedicine Discovery Institute and Department of Biochemistry and Molecular Biology, Monash University, Melbourne, Victoria, Australia（莫纳什大学生物医学发现研究所和生物化学与分子生物学系，墨尔本，维多利亚，澳大利亚） ； David R. Cheriton School of Computer Science, University of Waterloo, Waterloo, Ontario, Canada（加拿大滑铁卢大学戴维·R·切里顿计算机科学学校，滑铁卢，安大略，加拿大） ； Department of ICT and Center for AI Research, University of Agder (UiA), Jon Lilletuns vei 9, Grimstad, Norway（挪威阿格德大学（UiA）信息与通信技术系及人工智能研究中心，Jon Lilletuns vei 9，Grimstad，挪威） ； Department of Electronic Engineering, Tsinghua University, Beijing, China（清华大学电子工程系，北京，中国） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title,abstract)

AI总结 提出生物医学世界模型作为AI驱动发现的新范式，通过学习分子、细胞、组织和临床状态的潜在表征及干预条件动态，实现未来轨迹模拟，并探讨其在虚拟细胞、类器官、虚拟患者和手术模拟等应用中的潜力。

Understanding statistics for biomedical research through the lens of replication

通过复制的视角理解生物医学研究中的统计学

Huw Llewelyn

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title)

AI总结 通过复制视角分析生物医学研究中的统计学问题，指出复制概率受样本量和方差影响，并提出改进方法以提高复制可靠性。

Comments 30 pages, 3 figures, 2 tables. This paper includes a large amount of work that was done subsequently after comments and supersedes a previous paper submitted to arXiv (Reference number: 2403.16906 (https://arxiv.org/abs/2403.16906). I have not deleted or replaced the latter in case the moderators prefer both papers to be readable side-by-side

Interpreting Protein Language Model Embeddings via Orthogonal Projection for Protein Fitness Prediction

通过正交投影解释蛋白质语言模型嵌入以用于蛋白质适应性预测

Paulo Yanez Sarmiento, Pia Francesca Rissom, Manuel Pfeuffer, Marco Simnacher, Jordan F. Safer, Sumaiya Iqbal, Henrike O. Heyne, Nadja Klein, Bernhard Y. Renard

机构 * Hasso Plattner Institute, University of Potsdam（波茨坦大学哈索·普拉特纳研究所） ； Broad Institute of MIT and Harvard（麻省理工学院及哈佛大学布罗德研究所） ； Humboldt University of Berlin（柏林洪堡大学） ； Karlsruhe Institute of Technology（卡尔斯鲁厄理工学院） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 cs.LG、q-bio

AI总结 本研究提出通过正交投影技术去除蛋白质语言模型嵌入中的可解释生化特征效应，证明其编码与生化特性相关的模式并量化其对蛋白质适应性预测的贡献，该方法可迁移至其他问题场景。

Comments Preprint

Room-temperature graphene sub-terahertz detector integrated on a silicon dielectric waveguide

集成在硅介质波导上的室温石墨烯亚太赫兹探测器

A. Titchenko, K. Shein, M. Titova, M. Kashchenko, O. Popova, R. Izmaylov, E.I. Titova, I. Gayduchenko, G. Goltsman

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本研究展示了单片集成在高电阻率硅介质波导上的室温石墨烯亚太赫兹探测器，实现了D波段探测，其电压响应度达11.5 V/W，为全集成室温太赫兹光子回路提供了可行方案。