医学 AI

DrKGC: Dynamic Subgraph Retrieval-Augmented LLMs for Knowledge Graph Completion across General and Biomedical Domains

Yongkang Xiao, Sinian Zhang, Yi Dai, Huixue Zhou, Jue Hou, Jie Ding, Rui Zhang

机构 * University of Minnesota（明尼苏达大学） ； University of Michigan（密歇根大学） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title,abstract)；分类 cs.LG

Comments Accepted at EMNLP 2025 Findings

Biomedical Hypothesis Explainability with Graph-Based Context Retrieval

Ilya Tyagin, Saeideh Valipour, Aliaksandra Sikirzhytskaya, Michael Shtutman, Ilya Safro

机构 * Center for Bioinformatics and Computational Biology University of Delaware（生物信息学与计算生物学中心 大田纳西大学） ； Computer and Information Sciences University of Delaware（计算机与信息科学 大田纳西大学） ； Drug Discovery and Biomedical Sciences (DDBS) College of Pharmacy University of South Carolina（药物发现与生物医学科学（DDBS）药学院 美国南卡罗来纳大学） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title,abstract)

Comments 30 pages, 10 figures,

Non-Negative Stiefel Approximating Flow: Orthogonalish Matrix Optimization for Interpretable Embeddings

Brian B. Avants, Nicholas J. Tustison, James R Stone

机构 * Department of Radiology and Medical Imaging（放射科与医学影像学系） ； University of Virginia（弗吉尼亚大学） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 cs.CV、cs.LG

C3-Diff: Super-resolving Spatial Transcriptomics via Cross-modal Cross-content Contrastive Diffusion Modelling

Xiaofei Wang, Stephen Price, Chao Li

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 cs.CV

Approximating the Mathematical Structure of Psychodynamics

Bryce-Allen Bagley, Navin Khoshnan

机构 * Stanford University（斯坦福大学） ； Mathematical Medicine Group（数学医学组） ； Department of Neurosurgery（神经外科系） ； Physician-Scientist Training Program（医师科学家培训计划） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 q-bio

Light Focusing through Dynamic Media via Real-Valued Intensity Transmission Matrix

Xuan Liu, Sebastien Ourselin, Tianrui Zhao

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

Comments 11 pages, 6 figures

Mechanical instability generates monodisperse colloidosomes

Seungwoo Shin, Federico Cao, Robert A. Pelcovits, Thomas R. Powers, Zvonimir Dogic

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

SteganoSNN: SNN-Based Audio-in-Image Steganography with Encryption

Biswajit Kumar Sahoo, Pedro Machado, Isibor Kennedy Ihianle, Andreas Oikonomou, Srinivas Boppu

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

Two-way Coupling of Fluid--Structure Interaction for Elastic Magneto-Swimmers:A Finite Element ALE Approach

Christophe Prud'Homme, Vincent Chabannes, Laëtitia Giraldi, Agathe Chouippe, Céline Van Landeghem

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

RRTS Dataset: A Benchmark Colonoscopy Dataset from Resource-Limited Settings for Computer-Aided Diagnosis Research

Ridoy Chandra Shil, Ragib Abid, Tasnia Binte Mamun, Samiul Based Shuvo, Masfique Ahmed Bhuiyan, Jahid Ferdous

机构 * Department of Biomedical Engineering, Bangladesh University of Engineering and Technology (BUET), Dhaka, Bangladesh（生物医学工程系，孟加拉国工程大学） ； Dhaka Medical College, Dhaka, Bangladesh（达卡医学学院） 纠错

专题命中 医学数据与评测 ：diagnosis(title)；分类 cs.CV、eess.IV

Explaining Bayesian Neural Networks

Kirill Bykov, Marina M. -C. Höhne, Adelaida Creosteanu, Klaus-Robert Müller, Frederick Klauschen, Shinichi Nakajima, Marius Kloft

机构 * BIFOLD（BIFOLD；柏林技术大学） ； TU Berlin, Berlin, Germany（波茨坦ATB） ； ATB Potsdam, Potsdam, Germany（慕尼黑技术大学；MCML） ； TU Munich（波茨坦ATB；波茨坦大学） ； MCML, Munich, Germany（柏林技术大学；BIFOLD） ； ATB Potsdam（柏林技术大学机器学习组） ； University of Potsdam, Potsdam, Germany（韩国大学；马克斯·普朗克信息研究所） ； TU Berlin（查理研究所；BIFOLD，柏林；病理研究所，慕尼黑大学；德国癌症研究中心（DKTK）） ； BIFOLD, Berlin, Germany（鲁尔大学科隆） ； Machine Learning Group, TU Berlin, Berlin, Germany ； Korea University, Seoul, Korea ； Max Planck Institute for Informatics, Saarbrücken, Germany ； Institute of Pathology, Charité — Universitätsmedizin ； BIFOLD, Berlin ； Institute of Pathology, LMU Munich ； German Cancer Consortium (DKTK), Munich, Germany ； RPTU, Kaiserslautern, Germany 纠错

专题命中 医学数据与评测 ：pathology(abstract)；分类 cs.CV、cs.LG

Comments 25 pages, 8 figures Accepted to Transactions on Machine Learning Research

Local K-Similarity Constraint for Federated Learning with Label Noise

Sanskar Amgain, Prashant Shrestha, Bidur Khanal, Alina Devkota, Yash Raj Shrestha, Seungryul Baek, Prashnna Gyawali, Binod Bhattarai

机构 * NAAMII, Nepal Applied Mathematics and Informatics Institute for Research（NAAMII尼泊尔应用数学与信息学研究所） ； Rochester Institute of Technology（罗切斯特技术研究所） ； West Virginia University（西弗吉尼亚大学） ； University of Lausanne（洛桑大学） ； Ulsan National Institute of Science & Technology（釜山国家科学与技术研究所） ； University of Aberdeen（阿伯丁大学） 纠错

专题命中 医学数据与评测 ：medical image(abstract)；分类 cs.LG

Effective Predictive Modeling for Emergency Department Visits and Evaluating Exogenous Variables Impact: Using Explainable Meta-learning Gradient Boosting

Mehdi Neshat, Michael Phipps, Nikhil Jha, Danial Khojasteh, Michael Tong, Amir Gandomi

专题命中 医学数据与评测 ：diagnosis(abstract)；分类 cs.LG

How Well Do LLMs Understand Drug Mechanisms? A Knowledge + Reasoning Evaluation Dataset

Sunil Mohan, Theofanis Karaletsos

机构 * CZI 纠错

专题命中 医学数据与评测 ：biomedical(abstract)

Comments An earlier version of this paper appears in IEEE FLLM 2025. GitHub: https://github.com/czi-ai/DrugMechCounterfactuals