关于RNA二级结构的Reidys和Stadler度量

规范RNA伪纽结结构中的栈

Stacks in canonical RNA pseudoknot structures

本文研究了$k$ -非交叉、$τ$ -典型RNA假结结构（$<k,τ> $ -结构）中堆叠的分布.一个RNA结构被称为$k$ -非交叉的，如果它有不超过$k-1$相互交叉的弧，和$τ$ -规范的，如果每个弧包含在一个堆栈的长度至少$τ$。本文从$<k,τ>$ -结构的一般生成函数\cite{Reidys:08ma}出发，导出了二元生成函数${\bf T}_{k,τ}(x,u)=\sum_{n \geq 0} \sum_{0\leq t \leq \frac{n}{2}} {\sf T}_{k, τ}^{} (n,t) u^t x^n$，其中${\sf T}_{k,τ}(n,t)$是具有$t$堆栈的$<k,τ>$ -结构的个数，并研究了它的奇异性.我们表明，对于一定的参数化变量$u$，${\bf T}_{k,τ}(x,u)$有一个独特的，占主导地位的奇点。由$u$参数化的这种奇异性的特定移位意味着堆叠数分布的中心极限定理。我们的研究结果是重要的理解的“语言”的最小自由能RNA伪结结构，由计算机折叠算法产生。