生成真核生物参考基因组组装：地球生物基因组计划质量标准与建议
Generating eukaryotic reference genome assemblies: Earth BioGenome Project quality standards and recommendations
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本文由地球生物基因组计划委员会提出真核生物参考基因组组装的质量标准与建议，旨在确保高质量基因组资源以支持进化、生态保护及生物医学等应用。
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参考基因组组装是生物科学领域的基础资源，因为它们开始揭示每个物种的基本构建模块以及对于适应和生存至关重要的分子工具包。高质量的基因组能够促进对进化的洞察，便于生态系统监测、物种保护与保育，获取新的生物材料和生物医学资源，推动农业和水产养殖的进步，并支持地球健康。从物种基因组组装中收集的信息量直接取决于其质量。然而，不同的测序技术和软件解决方案会产生广泛的质量结果。在此，地球生物基因组计划的测序与组装委员会，连同从事真核生物测序和组装的大型研究者社区，概述了“参考”组装的质量标准，并制定建议以确保这些标准得到满足。
英文摘要
Reference genome assemblies are foundational resources across the biological sciences as they begin to expose the fundamental building blocks of each species and the molecular toolkits vital for adaptation and survival. High-quality genomes enable insights into evolution, facilitate ecosystem monitoring and protection and conservation of species, access to new biomaterials and biomedicine, advances in agri- and aquaculture, and support planetary health. The amount of information gathered from a species' genome assembly is directly dependent on its quality. However, different sequencing technologies and software solutions generate a wide range of quality outcomes. Here, the Earth BioGenome Project's Sequencing and Assembly committee, together with a large community of researchers performing eukaryote sequencing and assembly, outlines quality standards for a "reference" assembly and formulates recommendations to ensure these standards are met.
发表机构
- Wellcome Sanger Institute（威康桑格研究所）
- Finnish Museum of Natural History & Department of Organismal and Evolutionary Biology Faculty of Biological and Environmental Sciences University of Helsinki（赫尔辛基大学生物与环境科学学院有机体与进化生物学系芬兰自然历史博物馆）
- Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG)（国家基因组分析中心）
- Universitat de Barcelona (UB)（巴塞罗那大学）
- Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Univ Evry, Université Paris-Saclay（巴黎-萨克雷大学埃夫里大学法国国家科研中心CEA弗朗索瓦雅各布研究所基因组学中心）
- Globe Institute, University of Copenhagen（哥本哈根大学环球研究所）
- Mississippi State University（密西西比州立大学）
- Natural Sciences Museum of Barcelona（巴塞罗那自然科学博物馆）
- Yale School of Medicine（耶鲁大学医学院）
- Arizona Genomics Institute, The University of Arizona（亚利桑那大学亚利桑那基因组学研究所）
- Wise Ancestors（智者祖先公司）
- The Rockefeller University（洛克菲勒大学）
- Genotek Ltd.（Genotek有限公司）
- Hospital Sirio-Libanes（叙利亚黎巴嫩医院）
- National Human Genome Research Institute, National Institute of Health（美国国立卫生研究院人类基因组研究所）
- Royal Botanic Gardens, Kew（邱园皇家植物园）
- Julie Ann Wrigley Global Futures Laboratory, Walton Center for Planetary Health, Arizona State University（亚利桑那州立大学沃尔顿行星健康中心朱莉·安·赖格利全球未来实验室）
机构由 AI 辅助整理，请以论文原文为准。
