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用于排序数据的贝叶斯Plackett-Luce潜在块模型

Bayesian Plackett--Luce latent block models for ranked data

Lapo Santi, Nial Friel, Valeria Vitelli

arXiv 2607.26949首次发表:更新:

AI 中文总结

该研究提出了一种联合划分评估者与项目的贝叶斯Plackett-Luce潜在块模型,通过模拟验证其不确定性表征能力,将其应用于TCGA泛癌基因排序,揭示组织驱动的样本结构并支持生物学解释。

AI 中文摘要

我们引入了一种贝叶斯潜在块模型,该模型在Plackett-Luce观测模型下同时对评估者和项目进行划分。评估者被分配到C个簇,项目被分配到K个块;每个评估者簇内的块内项目共享一个共同的强度参数,从而产生简约的C×K共聚类表示。独立的Gnedin先验用于推断C和K。数据增广提供共轭吉布斯更新和具有分裂合并移动的易处理MCMC采样器。模拟在信号、排序深度和组平衡变化时表征恢复和后验不确定性。将该模型应用于癌症基因图谱(TCGA)泛癌前500个基因表达排序,揭示了组织驱动的样本结构,同时将基因水平异质性压缩为可解释的块。基于排序的GSEA对后验基因评分支持生物学解释。

英文摘要

We introduce a Bayesian latent block model that jointly partitions assessors and items under a Plackett--Luce observation model. Assessors are assigned to $C$ clusters and items to $K$ blocks; items in a block share a common strength parameter within each assessor cluster, yielding a parsimonious $C\times K$ co-clustering representation. Independent Gnedin priors infer $C$ and $K$. Data augmentation gives conjugate Gibbs updates and a tractable MCMC sampler with split-merge moves. Simulations characterize recovery and posterior uncertainty as signal, ranking depth, and group balance vary. Applied to the cancer gene atlas (TCGA) pan-cancer top-500 gene-expression rankings, the model reveals tissue-driven sample structure while compressing gene-level heterogeneity into interpretable blocks. Rank-based GSEA of posterior gene scores supports biological interpretation.

Comments53 pages, 12 figures

论文原文

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