分析配对 scRNA-Seq 与多重空间蛋白质组学中蛋白质组与转录组间的不一致性
Analyzing Lack of Concordance Between the Proteome and Transcriptome in Paired scRNA-Seq and Multiplexed Spatial Proteomics
AI总结：
本研究利用 HuBMAP 配对 scRNA-Seq 与多重空间蛋白质组学数据，揭示了关键免疫标志物转录本与蛋白质组间的不一致性，为基因表达调控与蛋白质功能复杂性提供了新见解。
摘要：
本研究利用来自 HuBMAP 的配对 scRNA-Seq 和多重空间蛋白质组学数据，分析了转录组和蛋白质组之间的不一致性。我们的发现突出了关键免疫标志物中持续存在的转录本，包括 CD45-RO、Ki67、CD45、CD20 和 HLA-DR。CD45-RO 在记忆 T 细胞中持续表达，而与细胞增殖相关的 Ki67 也表现出持续表达。此外，作为 MHC class II 分子一部分的 HLA-DR 表现出连续表达，这可能对抗原呈递细胞（APCs）触发有效的免疫反应至关重要。这项研究为基因表达调控和蛋白质功能的复杂性提供了新见解。
英文摘要：
In this study, we analyze discordance between the transcriptome and proteome using paired scRNA-Seq and multiplexed spatial proteomics data from HuBMAP. Our findings highlight persistent transcripts in key immune markers, including CD45-RO, Ki67, CD45, CD20, and HLA-DR. CD45-RO is consistently expressed in memory T cells, while Ki67, associated with cell proliferation, also displays sustained expression. Furthermore, HLA-DR, part of the MHC class II molecules, demonstrates continuous expression, possibly crucial for APCs to trigger an effective immune response. This investigation provides novel insights into the complexity of gene expression regulation and protein function.
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