爱杀死Penna老化模型
Love kills Penna ageing model
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机构、总结、中文摘要均由AI分析而来,可能存在错误,请以论文正文为准。
Love kills Penna ageing model
D. Stauffer, S. Cebrat
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Marry your Sister: Outbreeding Depression in Penna Ageing Model
如果在Penna的性老化模型中,条件的应用导致了互补的比特串,那么兄弟姐妹之间的婚姻,或者近亲之间的婚姻,可能会导致比无关夫妇更多的后代。
Child mortality in Penna ageing model
假设Penna老化模型中的有害突变主要影响年轻人,我们得到非常年轻时的死亡率增加,然后是死亡率的最小值,然后是通常的死亡率随年龄的指数增加。
Altruism and Antagonistic Pleiotropy in Penna Ageing Model
Penna老化模型基于突变累积理论。我们发现,它也允许自组织的拮抗性多效性,这有助于在年轻时在老年的代价。这可以解释为利他主义的出现。
Love kills: Simulations in Penna Ageing Model
标准的彭纳衰老模型(包含有性生殖)通过添加额外的爱的比特串而得到扩展:只有当男性的爱的弦与女性的爱的弦足够不同时,婚姻才会发生。我们模拟在什么水平的差异所需的人口灭绝。
Scaling effects in the Penna ageing model
我们已经分析了扩展性Penna老化模型的可能性。假设在生殖年龄之前表达的基因数量与基因组大小呈线性增长,并且每个基因组和世代的突变率是恒定的,我们发现,在最小生殖年龄之前表达的缺陷基因的比例随着基因组大小而下降,而通过遗传死亡消除的缺陷基因的数量随着基因组大小而增长。因此,进化成本随着基因组的扩大而降低。在根据突变时钟重新调整时间尺度后,种群的年龄分布不依赖于基因组大小。然而,扩大基因组会增加种群的繁殖潜力。
Gamete recognition and complementary haplotypes in sexual Penna ageing model
在模拟二倍体个体的有性生殖中,我们介绍了雌性单倍体配子识别基因组中的一个特定等位基因作为雄性单倍体配子的标记。它们与受精卵融合,最好是与具有不同标记的雄配子融合。这种配子识别在低重组率下增强了模拟二倍体个体中互补位串的优势。因此,在罕见的重组中,位串进化为互补的;而在重组率高于约0.1的情况下,它们在达尔文纯化选择下进化,只有很少的位发生突变。
The Penna Model of Biological Aging
本文综述了生物衰老的计算机模拟,特别是1995年的Penna模型。
Search for bottleneck effects in Penna ageing and Schulze language model
在两个具有记忆效应的模型中,当种群在平衡建立后急剧减少,然后再次增加时,没有看到任何影响。
Simulations of a mortality plateau in the sexual Penna model for biological ageing
Penna模型是一种模拟年龄结构种群遗传动力学的策略,其中个体基因组由位串表示。它提供了一个简单的隐喻的进化过程中的突变积累理论。在其原始版本中,当个体当前累积的突变数量n达到阈值T时,个体因遗传性疾病而死亡。由于累积疾病的数量随着年龄的增长而增加,因此对于非常年轻的年龄(n < T),死亡概率为零,对于老年人(n >= T),死亡概率为1。在这里,我们没有使用阶跃函数来确定遗传死亡年龄,而是测试了其他几个函数,这些函数可能会或可能不会稍微增加年轻时的死亡概率(n < T),但会降低老年时的死亡概率。我们的目的是研究最古老的老年效应,即高龄死亡率曲线的平台。在一定条件下,使用Penna模型可以获得清晰的平台。然而,一个更现实的一个出现时,一个修改后的版本,保持人口规模不变,没有波动,是使用。我们还发现了出生率、人口年龄结构和死亡概率之间的关系。
Positive mutations and mutation-dependent Verhulst factor in Penna ageing model
我们两次修改Penna模型的生物老化。首先,我们将返回(好)突变和它们的记忆引入模型。它使我们能够观察到物种适应度在长时间尺度上的改善以及间断平衡。其次,我们采用了一个食物/空间竞争因子,该因子取决于个体基因组中累积的突变数量,并摆脱了固定的允许突变数量限制。除了重现标准模型的主要结果外,我们还观察到最年长者的死亡率最大值。
Inbreeding and outbreeding depressions in the Penna model as a result of crossover frequency
Penna性老化模型中的人口首先被分成几个生殖隔离的群体。然后,在平衡之后,允许组之间的性别混合。我们研究的变化,由于这种混合的人口规模和解释他们通过一个反作用的纯化选择和单倍型互补。
The dauer mutation of the caenorhabditis elegans, simulated with the Penna and the Stauffer model
两个老化模型进行了分析,他们是否可以证实,dauer突变的线虫有助于保护物种。因此,Penna模型表明,有Dauer幼虫的种群在恶劣的环境条件下生存,而没有Dauer幼虫的种群则会灭绝。在Stauffer模型中,dauer突变对生存的优势仅在一定条件下给出。
Penna bit-string model with constant population
我们从Penna生物老化模型中删除了任何随机杀死Verhulst因子。死亡仅由遗传疾病引起,人口规模是固定的,而不是围绕某个恒定值波动。我们表明,这些修改给出了定性相同的结果,在早期的文件中,随机杀戮(用于避免人口的指数增长)仅适用于新生儿。
Influence of a small fraction of individuals with enhanced mutations on a population genetic pool
Penna老化模型的计算机模拟表明,已经有一小部分新生儿的新突变数量增加,可能会对整个人口产生负面影响。
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